Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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