Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Apobec3Q99J72 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms