Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Vipas39Q8BGQ1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Vipas39Q8BGQ1 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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Vipas39Q8BGQ1 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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