Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc18Q640L5 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms