Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Hoxd1Q01822 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Hoxd1Q01822 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Hoxd1Q01822 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd1Q01822 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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