Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Irx1P81068 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Irx1P81068 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms