Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Sh3bp1P55194 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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