Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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