Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb1P17919 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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