Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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