Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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