Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc18Q640L5 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms