Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd13P70217 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms