Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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