Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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