Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Cldn34c2J3QNM1 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms