Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gm21818J3KMS6 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms