Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms