Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rabgef1Q9JM13 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms