Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms