Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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