Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Cln3Q61124 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cln3Q61124 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Cln3Q61124 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cln3Q61124 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms