Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms