Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VdrP48281 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VdrP48281 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
VdrP48281 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms