Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtprmP28828 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms