Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Hoxd10P28359 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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Hoxd10P28359 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Hoxd10P28359 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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Hoxd10P28359 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms