Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms