Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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