Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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Limd1Q9QXD8 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms