Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Col5a3Q9JLI2 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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