Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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