Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Pggt1bQ8BUY9 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Pggt1bQ8BUY9 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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