Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.2 ms