Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp4P35123 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp4P35123 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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