Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PtprmP28828 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PtprmP28828 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms