Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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