Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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