Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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