Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rnu3b4-201ENSMUST00000184171 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b2-201ENSMUST00000185073 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b2-202ENSMUST00000196353 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Iglc4-201ENSMUST00000197046 314 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b3-202ENSMUST00000198628 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b4-202ENSMUST00000199460 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b1-202ENSMUST00000200547 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm44426-201ENSMUST00000204258 355 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm35177-201ENSMUST00000216525 623 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Krtap10-4-201ENSMUST00000092369 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Rnu3b3-201ENSMUST00000093738 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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Gm21887J3QQ04 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Gm21887J3QQ04 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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Gm21887J3QQ04 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Gm21887J3QQ04 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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Gm21887J3QQ04 Gm8814-201ENSMUST00000119072 535 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm15864-201ENSMUST00000145950 369 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms