Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Limd1Q9QXD8 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms