Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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