Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ube2cQ9D1C1 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms