Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RpainQ9CWY9 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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