Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Ccdc18Q640L5 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc18Q640L5 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc18Q640L5 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc18Q640L5 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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