Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Klf3Q60980 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Klf3Q60980 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms