Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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