Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxb1P17919 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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