Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms