Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Irx4Q9QY61 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Irx4Q9QY61 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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