Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Efcc1Q9JJF6 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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